MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 1348

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187126	C	14	14	1	14	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2	NT_187126	C	9	9	16	24	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3	NT_187126	ATC	2	6	31	36	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NT_187126	CGC	2	6	57	62	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NT_187126	TCG	2	6	65	70	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NT_187126	CAT	3	9	81	89	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NT_187126	CGC	2	6	90	95	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NT_187126	ATC	2	6	97	102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NT_187126	CGC	2	6	123	128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10	NT_187126	GCC	2	6	151	156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11	NT_187126	TCG	2	6	158	163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NT_187126	CGC	2	6	177	182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13	NT_187126	G	7	7	197	203	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
14	NT_187126	GCA	2	6	269	274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NT_187126	CGC	2	6	276	281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16	NT_187126	GAG	2	6	365	370	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409247807
17	NT_187126	TCA	2	6	392	397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409247807
18	NT_187126	GCG	2	6	410	415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247807
19	NT_187126	TAA	2	6	428	433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409247807
20	NT_187126	AGCGAT	2	12	448	459	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	409247807
21	NT_187126	T	6	6	469	474	0 %	100 %	0 %	0 %	409247807
22	NT_187126	TTAA	2	8	495	502	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NT_187126	ATG	2	6	546	551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247808
24	NT_187126	GAA	2	6	561	566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409247808
25	NT_187126	TTTAT	2	10	582	591	20 %	80 %	0 %	0 %	409247808
26	NT_187126	CAGGT	2	10	603	612	20 %	20 %	40 %	20 %	409247808
27	NT_187126	TAT	2	6	632	637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NT_187126	TGAA	2	8	646	653	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NT_187126	ATT	2	6	694	699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NT_187126	TTTA	2	8	719	726	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NT_187126	AAT	2	6	758	763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NT_187126	TAAT	2	8	816	823	50 %	50 %	0 %	0 %	409247809
33	NT_187126	AATTT	2	10	836	845	40 %	60 %	0 %	0 %	409247809
34	NT_187126	GAC	2	6	936	941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247809
35	NT_187126	CGC	2	6	1100	1105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247809
36	NT_187126	AGC	2	6	1184	1189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247809
37	NT_187126	CGC	3	9	1259	1267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247809
38	NT_187126	CGC	2	6	1286	1291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247809
39	NT_187126	GCA	2	6	1331	1336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247809
40	NT_187126	TCC	2	6	1351	1356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409247809
41	NT_187126	CG	3	6	1377	1382	0 %	0 %	50 %	50 %	409247809
42	NT_187126	GTC	2	6	1431	1436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247809
43	NT_187126	TGT	2	6	1480	1485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409247809
44	NT_187126	CAG	2	6	1500	1505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247809
45	NT_187126	GCCCG	2	10	1515	1524	0 %	0 %	40 %	60 %	409247809
46	NT_187126	CGA	2	6	1663	1668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247809
47	NT_187126	GC	3	6	1725	1730	0 %	0 %	50 %	50 %	409247809
48	NT_187126	TGC	2	6	1744	1749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247809
49	NT_187126	GCA	2	6	1751	1756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247809
50	NT_187126	GCA	2	6	1775	1780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247809
51	NT_187126	GCC	2	6	1803	1808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247809
52	NT_187126	GAG	2	6	1810	1815	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409247809
53	NT_187126	GCG	2	6	1829	1834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247809
54	NT_187126	AAT	2	6	1842	1847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409247809
55	NT_187126	GGC	2	6	1866	1871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247809
56	NT_187126	CCA	2	6	1883	1888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409247809
57	NT_187126	CCG	2	6	1913	1918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247809
58	NT_187126	TCG	2	6	1945	1950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247809
59	NT_187126	GCCA	2	8	1966	1973	25 %	0 %	25 %	50 %	409247809
60	NT_187126	TCG	2	6	1993	1998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247809
61	NT_187126	CAG	2	6	2097	2102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247809
62	NT_187126	CCG	2	6	2134	2139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247809
63	NT_187126	GTCGCG	2	12	2151	2162	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	409247809
64	NT_187126	TGGT	2	8	2229	2236	0 %	50 %	50 %	0 %	409247810
65	NT_187126	T	6	6	2236	2241	0 %	100 %	0 %	0 %	409247810
66	NT_187126	ACG	2	6	2298	2303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247810
67	NT_187126	TGA	2	6	2376	2381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247810
68	NT_187126	CAG	2	6	2450	2455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247810
69	NT_187126	ACC	2	6	2458	2463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409247810
70	NT_187126	CCAG	2	8	2524	2531	25 %	0 %	25 %	50 %	409247810
71	NT_187126	GC	3	6	2539	2544	0 %	0 %	50 %	50 %	409247810
72	NT_187126	GAA	2	6	2549	2554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409247810
73	NT_187126	GGCG	2	8	2564	2571	0 %	0 %	75 %	25 %	409247810
74	NT_187126	GGT	2	6	2573	2578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409247810
75	NT_187126	CAA	2	6	2621	2626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409247810
76	NT_187126	GCC	3	9	2630	2638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247810
77	NT_187126	AACC	2	8	2668	2675	50 %	0 %	0 %	50 %	409247810
78	NT_187126	GAT	2	6	2792	2797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247810
79	NT_187126	AAT	2	6	2885	2890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409247810
80	NT_187126	ATT	2	6	2945	2950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409247810
81	NT_187126	GC	3	6	2969	2974	0 %	0 %	50 %	50 %	409247810
82	NT_187126	TTA	2	6	2991	2996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409247810
83	NT_187126	A	6	6	3033	3038	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NT_187126	A	7	7	3040	3046	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NT_187126	GCC	2	6	3077	3082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
86	NT_187126	A	6	6	3161	3166	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NT_187126	AAT	2	6	3190	3195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409247811
88	NT_187126	CAC	2	6	3210	3215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409247811
89	NT_187126	CG	3	6	3229	3234	0 %	0 %	50 %	50 %	409247811
90	NT_187126	T	6	6	3300	3305	0 %	100 %	0 %	0 %	409247811
91	NT_187126	CGC	2	6	3446	3451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247811
92	NT_187126	GC	3	6	3458	3463	0 %	0 %	50 %	50 %	409247811
93	NT_187126	TCC	2	6	3528	3533	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409247812
94	NT_187126	TGT	2	6	3576	3581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409247812
95	NT_187126	TCT	2	6	3717	3722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409247812
96	NT_187126	GTTC	2	8	3730	3737	0 %	50 %	25 %	25 %	409247812
97	NT_187126	GTC	2	6	3749	3754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247812
98	NT_187126	GAT	2	6	3755	3760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247812
99	NT_187126	GCC	2	6	3782	3787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247812
100	NT_187126	CAT	2	6	3848	3853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409247812
101	NT_187126	AGC	2	6	3873	3878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247812
102	NT_187126	CAG	2	6	3902	3907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247812
103	NT_187126	GCC	2	6	3929	3934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247812
104	NT_187126	GAT	2	6	3974	3979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247812
105	NT_187126	TGC	2	6	4129	4134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247812
106	NT_187126	GC	3	6	4237	4242	0 %	0 %	50 %	50 %	409247812
107	NT_187126	CCA	2	6	4315	4320	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409247812
108	NT_187126	CCGC	2	8	4341	4348	0 %	0 %	25 %	75 %	409247812
109	NT_187126	GCG	2	6	4420	4425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247812
110	NT_187126	TGC	2	6	4428	4433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247812
111	NT_187126	ACG	2	6	4459	4464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247812
112	NT_187126	CAG	2	6	4466	4471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247812
113	NT_187126	AC	3	6	4490	4495	50 %	0 %	0 %	50 %	409247812
114	NT_187126	CAG	2	6	4526	4531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247812
115	NT_187126	TTC	2	6	4532	4537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409247812
116	NT_187126	GTT	3	9	4610	4618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409247812
117	NT_187126	GCC	2	6	4679	4684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247812
118	NT_187126	GCC	2	6	4719	4724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247812
119	NT_187126	GCG	2	6	4749	4754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247812
120	NT_187126	GC	3	6	4795	4800	0 %	0 %	50 %	50 %	409247812
121	NT_187126	GCA	2	6	4909	4914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247812
122	NT_187126	AGC	2	6	4956	4961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247812
123	NT_187126	CTT	2	6	4999	5004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409247812
124	NT_187126	CG	3	6	5031	5036	0 %	0 %	50 %	50 %	409247812
125	NT_187126	GCC	2	6	5066	5071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247812
126	NT_187126	CAG	2	6	5084	5089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247812
127	NT_187126	CGC	2	6	5278	5283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247812
128	NT_187126	AGA	2	6	5344	5349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409247812
129	NT_187126	CTG	2	6	5414	5419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247812
130	NT_187126	GT	3	6	5445	5450	0 %	50 %	50 %	0 %	409247812
131	NT_187126	ACGC	2	8	5453	5460	25 %	0 %	25 %	50 %	409247812
132	NT_187126	GCT	2	6	5485	5490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247812
133	NT_187126	CGC	2	6	5491	5496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247812
134	NT_187126	GC	3	6	5572	5577	0 %	0 %	50 %	50 %	409247812
135	NT_187126	CAG	2	6	5594	5599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247812
136	NT_187126	CCG	3	9	5601	5609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247812
137	NT_187126	ACC	2	6	5610	5615	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409247812
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268	NT_187126	AAT	2	6	12780	12785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409247820
269	NT_187126	AGC	2	6	12899	12904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247820
270	NT_187126	GGC	2	6	12949	12954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247820
271	NT_187126	CG	3	6	12977	12982	0 %	0 %	50 %	50 %	409247820
272	NT_187126	CCG	2	6	12999	13004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247820
273	NT_187126	GGAT	2	8	13050	13057	25 %	25 %	50 %	0 %	409247820
274	NT_187126	CAG	2	6	13063	13068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247820
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276	NT_187126	A	7	7	13126	13132	100 %	0 %	0 %	0 %	409247820
277	NT_187126	GCA	2	6	13165	13170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247820
278	NT_187126	GA	4	8	13180	13187	50 %	0 %	50 %	0 %	409247820
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280	NT_187126	CAGG	2	8	13233	13240	25 %	0 %	50 %	25 %	409247820
281	NT_187126	TAAT	2	8	13268	13275	50 %	50 %	0 %	0 %	409247820
282	NT_187126	CAAA	2	8	13311	13318	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
283	NT_187126	GAC	2	6	13369	13374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247821
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287	NT_187126	CAG	2	6	13540	13545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247821
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289	NT_187126	CGA	2	6	13616	13621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247821
290	NT_187126	AG	3	6	13633	13638	50 %	0 %	50 %	0 %	409247821
291	NT_187126	T	6	6	13681	13686	0 %	100 %	0 %	0 %	409247821
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301	NT_187126	GGC	2	6	14419	14424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247822
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307	NT_187126	T	7	7	14802	14808	0 %	100 %	0 %	0 %	409247823
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381	NT_187126	GGT	2	6	18419	18424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409247829
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396	NT_187126	CTG	2	6	19134	19139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247829
397	NT_187126	CCAG	2	8	19235	19242	25 %	0 %	25 %	50 %	409247829
398	NT_187126	GGT	2	6	19262	19267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409247829
399	NT_187126	TCG	2	6	19276	19281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247829
400	NT_187126	AGC	2	6	19282	19287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247829
401	NT_187126	GCC	2	6	19341	19346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247829
402	NT_187126	GGC	2	6	19410	19415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247829
403	NT_187126	GC	3	6	19414	19419	0 %	0 %	50 %	50 %	409247829
404	NT_187126	CGT	2	6	19481	19486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247829
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408	NT_187126	T	6	6	19654	19659	0 %	100 %	0 %	0 %	409247829
409	NT_187126	CAG	2	6	19668	19673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247829
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412	NT_187126	CCG	2	6	19861	19866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
413	NT_187126	ACA	2	6	19892	19897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
414	NT_187126	GCC	2	6	19919	19924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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417	NT_187126	GAA	2	6	20021	20026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
418	NT_187126	AAC	2	6	20045	20050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
419	NT_187126	CAGC	2	8	20071	20078	25 %	0 %	25 %	50 %	409247830
420	NT_187126	TGT	2	6	20090	20095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409247830
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422	NT_187126	T	7	7	20202	20208	0 %	100 %	0 %	0 %	409247830
423	NT_187126	ACG	2	6	20246	20251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247830
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431	NT_187126	CGG	2	6	20662	20667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
432	NT_187126	GGC	2	6	20669	20674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
433	NT_187126	GCC	2	6	20685	20690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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437	NT_187126	GCG	2	6	20910	20915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
438	NT_187126	ATT	2	6	20927	20932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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440	NT_187126	GCG	2	6	20959	20964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247831
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471	NT_187126	AG	3	6	22333	22338	50 %	0 %	50 %	0 %	409247831
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477	NT_187126	TTC	2	6	22704	22709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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482	NT_187126	TGA	2	6	22796	22801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247833
483	NT_187126	TCTGG	2	10	22854	22863	0 %	40 %	40 %	20 %	409247833
484	NT_187126	ACG	2	6	22921	22926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247833
485	NT_187126	TGA	2	6	22988	22993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247833
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498	NT_187126	GCC	2	6	23410	23415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
499	NT_187126	TAT	2	6	23441	23446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
500	NT_187126	ATC	2	6	23461	23466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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